La harina de mijo es una alternativa importante y saludable para el trigo. Para las personas que son alérgicas al gluten o están evitando éste como parte de una dieta, la harina de mijo está naturalmente libre de esta proteína. El mijo en polvo también se mezcla con harina de trigo o de arroz para reducir las cantidades de gluten; estos métodos se utilizan para aquellos que evitan esta proteína en dosis altas aunque no son alérgicos a esta sustancia.

La harina de mijo se utiliza comúnmente en la cocción. Históricamente, en especial en las zonas donde el trigo no es tan común, se utilizaba para hacer varios tipos de pan, magdalenas y otros tipos de productos horneados.